為提升五股往返八里及板橋服務運能，指南客運與淡水客運公告，九六三「八里—板橋」直達車自九月卅日起整併入全程車（正線）行駛，引發網友與通勤族討論，憂心通勤時間拉長、九八八替代量能不足及八里交通壅塞。淡水客運協理蔡其男回應，整併是依據實際客況調配運能，總班次並未減少。淡水客運公告，九六三自九月卅日起調整營運模式，原有直達車併入全程車（正線）行駛，平常日共廿六班次，例假日則維持四班次。消息曝光後引發地方社群熱議，不少民眾認為「好不容易可以縮短路程到板橋，這樣又多花很多時間」、「不能再開一班八里到板橋走快速道路的公車嗎？不能只照顧淡水區。」針對替代方案九八八公車，民眾也反映「九八八上台六十四線不能站立，從淡水開到八里都沒幾個位子，是一場賭注」，同時對九六三假日一整天僅有四班車感到費解。